Slutningen?

Er der nogle der vil hjælpe mig med at forklare slutningen? Jeg kan ikke rigtig gennemskue hvordan den kan slutte med at "nutiden" er en abeverden?
[SPOILER]
Den måde aberne fik herskerskabet over verden, var da den der rumstation "Calima" styrtede ned på "Jorden", da de ledte efter Leo. Derefter gjorte aberne oprør - der havde været "lidt for lærenemme" - og hvor vi introduceres for Cemos, der viser sig at være "rigtig".
Så når Leo rejser tilbage til "nutiden", før "Calima" syrter ned, hvordan kan aberne så havde overtaget Jorden, og Lincoln blive erstattet af Thade?